PROTÉINES RECOMBINANTES

Deux étapes. Un train. Purification continue de protéines recombinantes.

Capture CaptureSMB® et polissage MCSGP sur la plateforme Contichrom®.

 

MCSGP démontré en collaboration avec Bristol Myers Squibb sur une protéine PEGylée à 98 % de pureté cible : +8,2 pp Rendement (73,1→79,1 %) | +17,8 % Productivité | −15 % PMI | COG le plus bas parmi les cinq scénarios modélisés. Avec MCSGP à double pente : le rendement augmente encore de +20–23 pp par rapport au maximum en batch.

 

CaptureSMB® validé séparément à échelle 100× par BMS pour la capture sur Protéine A.

 

Sources : Kim et al., J. Chromatogr. A (2022) — étude COG à échelle industrielle BMS ; Kim et al., J. Chromatogr. A (2023) — MCSGP à double pente ; CaptureSMB®, validation à échelle de production BMS : Angelo et al., BioProcess International 2018

Le goulot d'étranglement de la capture par affinité

La chromatographie batch en mode liaison-élution laisse la capacité de la résine systématiquement sous-utilisée. Une colonne est chargée à 60–80 % de la capacité de liaison dynamique pour éviter la percée du produit — ce qui signifie que 20–40 % de la résine d’affinité coûteuse reste inactive à chaque cycle.

Pour les résines à coût élevé — Protéine L pour les fragments F(ab’)₂, Protéine A pour les protéines de fusion Fc, ou supports d’affinité personnalisés pour de nouvelles structures — cette sous-utilisation augmente directement le coût des marchandises. Ajoutez les volumes de tampon importants requis pour le cyclage en batch et les longs temps de traitement pour les flux à titre élevé, et la capture par affinité devient un goulot d’étranglement de fabrication significatif.

Pour les fabricants visant un traitement en aval continu ou une intégration avec des bioréacteurs à perfusion, la capture en batch introduit également la plus grande discontinuité temporelle du train de procédé.

La solution : capture par affinité continue CaptureSMB®

CaptureSMB® utilise une stratégie de chargement à contre-courant à deux colonnes pour maximiser l’utilisation de la résine d’affinité. Pendant que la première colonne atteint la saturation complète, la percée est capturée sur la seconde colonne — garantissant un chargement quasi complet des deux colonnes avant toute élution. L’utilisation de la résine atteint systématiquement ≥95 % contre 60–80 % pour le chargement en batch.

Le contrôle de procédé dynamique AutomAb® surveille la percée UV en temps réel et déclenche automatiquement le basculement de colonne, maintenant un chargement optimal indépendamment de la variation du titre d’alimentation — permettant un fonctionnement robuste directement couplé à un bioréacteur à perfusion ou à un train de clarification continu.

CaptureSMB® est compatible avec toute résine de capture par affinité, IEX ou en mode mixte — Protéine A, Protéine L, Protéine G et ligands d’affinité personnalisés.

Fonctionne avec toute résine d’affinité. CaptureSMB® a été démontré pour la Protéine A (capture de mAb et de fusion Fc), la Protéine L / KappaSelect (capture de fragments F(ab’)₂ et de chaîne légère κ), et des résines d’affinité personnalisées. Le principe à deux colonnes s’applique à tout système liaison-élution où maximiser l’utilisation de la résine et minimiser la consommation de tampon est précieux.

En savoir plus sur CaptureSMB® avec AutomAb®
CaptureSMB Continuous chromatography — illustration

Résultats prouvés : CaptureSMB® vs. Batch – Capture par affinité – F(ab’)₂

64 % ↑

Charge

>30 %

Économies de coût de résine (F(ab’)₂ / Protéine L)

1,9×

Productivité

54 % ↓

Consommation de tampon

Tableau comparatif de purification de protéines (étape de capture) :

Paramètre Batch liaison-élution CaptureSMB® avec AutomAb®
Utilisation de la résine 60 % (évitement de la percée) ≥95 % — le chargement à contre-courant sature les deux colonnes
Coût de la résine Référence >30 % d’économies démontrées pour la Protéine L
Concentration du produit Référence 2,2× supérieure dans l’éluat (F(ab’)₂)
Consommation de tampon Élevée (charge faible = volumes de lavage/élution importants par g) Réduite de 54 % (charge élevée = volumes de lavage/élution réduits par g)
Gestion de la variabilité d’alimentation Limite de percée fixe ; ajustement manuel requis AutomAb® ajuste dynamiquement le basculement de colonne au signal UV en temps réel
Intégration à la perfusion Rétentions en batch requises entre récolte et capture Couplage direct
Contrôle de procédé Basculement de colonne manuel ou basé sur minuterie Automatisé (PAT basé sur UV AutomAb®)
Compatibilité résine / tampon Toute affinité, IEX ou mode mixte Identique — aucun changement requis

Le goulot d'étranglement du polissage dans la biofabrication de protéines

Les protéines recombinantes éluent rarement sous forme d’une seule espèce pure. Les variants de charge, les agrégats, les isoformes PEGylées et les impuretés liées au procédé co-éluent avec la cible — et le polissage batch conventionnel ne peut pas les résoudre sans un compromis coûteux.

Une coupe centrale étroite atteint la pureté cible mais rejette de grandes fractions de produit coûteux. Élargir la coupe améliore le rendement mais échoue aux spécifications de pureté. Récupérer les fractions latérales par re-chromatographie ajoute du temps, du tampon et de la complexité.

Pour les protéines à haute valeur — y compris les bioconjugués PEGylés, les protéines de fusion Fc, les cytokines, les enzymes recombinantes et les facteurs de croissance — cette inefficacité augmente directement le coût des marchandises et retarde le débit de fabrication.

Recombinant protein purification — illustration

La solution : polissage continu MCSGP

MCSGP (Multi-column Countercurrent Solvent Gradient Purification) élimine le compromis pureté–rendement. Deux colonnes identiques recyclent en continu les fractions latérales impures dans le cycle de purification — récupérant le produit que les procédés batch rejettent comme déchet. Il fonctionne avec les mêmes résines et tampons IEX, HIC, mode mixte ou affinité déjà utilisés dans votre étape de polissage.

Le contrôle de procédé dynamique AutoPeak® surveille les profils d’élution en temps réel via UV et conductivité, ajustant automatiquement les fenêtres de collecte pour maintenir une qualité de sortie constante — permettant un fonctionnement robuste et sans surveillance 24/7.

Même chimie. Meilleurs résultats. MCSGP est compatible avec les résines échangeuses de cations (CEX), échangeuses d’anions (AEX), interaction hydrophobe (HIC) et mode mixte à toute taille de colonne. Votre résine et vos conditions de tampon existantes sont le point de départ — aucun changement de votre chimie chromatographique n’est requis.

En savoir plus sur MCSGP + AutoPeak®
Continuous chromatography - MCSGP — illustration

Résultats prouvés : MCSGP vs. polissage batch – Protéine PEGylée

+8–23 %

Augmentation du rendement

17 % ↓

Réduction PMI / tampon

18 % ↑

Gain de productivité

Zéro

Essais de re-chromatographie

Tableau comparatif de purification de protéines (polissage) :

Paramètre Polissage batch MCSGP avec AutoPeak®
Compromis pureté–rendement Inhérent — les coupes étroites sacrifient le rendement Éliminé — pureté ET rendement élevés simultanément
Rendement du produit 60–80 % (étape de polissage typique) Amélioration absolue de +8–23 %
Re-chromatographie Requise pour les fractions latérales hors spécification Éliminée — recyclage interne à contre-courant
Consommation de tampon (PMI) Élevée −15 % démontré à échelle industrielle
Productivité Limitée par le débit d’une seule colonne Amélioration jusqu’à +18 %
Coût des marchandises Référence Réduit dans tous les scénarios de fabrication
Flexibilité de campagne Cadence batch fixe Ajustable en réglant le nombre de cycles et le diamètre de colonne
Contrôle de procédé Collecte de fractions manuelle Automatisé (PAT basé sur UV AutoPeak®)

La plateforme Contichrom® : du développement à échelle laboratoire à la production GMP

Tous les systèmes Contichrom® supportent la chromatographie continue à deux colonnes. Les méthodes de polissage MCSGP se mettent à l’échelle de CUBE → TWIN LPLC Polishing ; les méthodes de capture CaptureSMB se mettent à l’échelle de CUBE → TWIN LPLC Capture.

Applications CaptureSMB :

Protéines de fusion Fc (étape de capture)

Les protéines de fusion Fc sont capturées via affinité Protéine A — la même résine et méthode que pour les mAb complets. Le chargement continu CaptureSMB® s’applique directement, maximisant l’utilisation de la résine et la concentration du produit pour cette classe croissante de thérapeutiques.


Fragments d’anticorps — F(ab’)₂, Fab, scFv, nanobodies

Les fragments d’anticorps dépourvus de région Fc nécessitent Protéine L, Protéine G, Protéine A (pour les fragments contenant Fc), ou des résines d’affinité personnalisées. CaptureSMB® a été démontré pour la capture de F(ab’)₂ utilisant Protéine L (>30 % d’économies de résine, concentration du produit 2,2× vs. batch) et s’applique à tout fragment contenant une chaîne légère κ.


Protéines recombinantes avec résines d’affinité personnalisées

De nombreuses protéines recombinantes sont capturées par des résines d’affinité ou de mode mixte personnalisées. CaptureSMB® est compatible avec tout système liaison-élution — les avantages de performance (≥95 % d’utilisation de résine, concentration de produit plus élevée, utilisation réduite de tampon) se mettent à l’échelle pour tout coût de résine d’affinité et titre.


Fabrication continue couplée à la perfusion

Le mode de chargement continu de CaptureSMB se couple directement à la sortie du bioréacteur à perfusion — éliminant les grands réservoirs de rétention intermédiaires, réduisant l’empreinte de l’installation et permettant une véritable biofabrication continue de bout en bout de l’expression à la substance médicamenteuse purifiée.

Applications de polissage MCSGP :

Protéines PEGylées

La PEGylation crée plusieurs isoformes (mono-, di-, multi-PEGylées) qui se chevauchent en chromatographie IEX ou AEX conventionnelle. MCSGP sépare les isoformes avec pureté et rendement élevés simultanés — démontré sur des molécules modèles et industriellement pertinentes avec analyse COG complète (collaboration BMS).


Cytokines recombinantes et facteurs de croissance

Les cytokines (IL-2, IFN-α, G-CSF, EPO) et les facteurs de croissance sont produites sous forme de mélanges de variants de charge issus d’une expression microbienne ou mammalienne. Le polissage MCSGP en IEX récupère l’isoforme cible avec un rendement élevé tout en rejetant les espèces désamidées, oxydées ou tronquées — sans la perte de rendement liée au center-cutting en mode batch.


Enzymes recombinantes

Les enzymes produites dans des systèmes microbiens ou de levure présentent des impuretés liées au procédé et des isoformes nécessitant un polissage. MCSGP s’applique partout où un polissage IEX en gradient, HIC ou en mode mixte est déjà utilisé — la version continue fonctionne avec la même résine et le même système tampon, sans changement de chimie.


Protéines de fusion Fc (étape de polissage)

Les protéines de fusion Fc (p. ex. étanercept, classe romiplostim) nécessitent un polissage des variants de charge après la capture sur Protéine A. Le polissage continu MCSGP en IEX ou HIC s’applique directement, éliminant les variants acides/basiques avec un rendement supérieur au center-cutting en mode batch et permettant, si nécessaire, des spécifications CQA plus strictes.


Élimination des agrégats et des impuretés

Les agrégats protéiques et les espèces de haut poids moléculaire co-éluant avec le pic du monomère ne peuvent pas être éliminés avec un rendement élevé par center-cutting en mode batch. MCSGP recycle ces fractions latérales en interne, récupérant le produit monomère tout en respectant des limites de spécification d’agrégats strictes.

Bien démarrer avec MCSGP et CaptureSMB® pour les protéines recombinantes

Découvrez la plateforme Contichrom® en action avant de vous engager, puis évaluez le polissage MCSGP, la capture CaptureSMB® ou les deux — par modélisation à partir de vos données batch existantes, ou expérimentalement sur le site de YMC ChromaCon à Zurich. Développez vos méthodes sur un Contichrom CUBE et passez à l’échelle sur le TWIN LPLC pour une production GMP.

Voir d’abord — démo ou webinaire gratuit

Vous ne connaissez pas encore la plateforme Contichrom® ? Commencez ici. YMC ChromaCon propose des démonstrations gratuites et des webinaires d’introduction adaptés à votre équipe.

  • Sur site à Zurich (demi-journée, 2–4 heures) : voir le CUBE en personne, exécuter ChromIQ® en direct, discuter de votre défi de purification de protéines recombinantes avec les scientifiques d’application de YMC ChromaCon
  • Webinaire à distance (1–3 heures) : session interactive en direct couvrant MCSGP, CaptureSMB®, N-Rich®, le logiciel ChromIQ® et l’écosystème Contichrom® complet
  • Les sessions peuvent couvrir à la fois le polissage (MCSGP) et la capture (CaptureSMB®) dans le même échange

→ Demander une démo gratuite ou un webinaire d’introduction

Évaluation par modélisation pour les protéines

Prédisez les performances de la chromatographie continue sur votre procédé protéique avant de lancer de nouvelles expériences. YMC ChromaCon construit des modèles mécanistes calibrés à partir de vos données batch existantes.

  • Pour le polissage MCSGP (IEX, HIC) : soumettez des essais batch en gradient avec analyse des fractions ; YMC ChromaCon simule le rendement, la pureté et la productivité MCSGP par rapport à votre étape de polissage batch
  • Pour la capture CaptureSMB® (affinité, bind-elute) : soumettez des données de courbe de percée ; YMC ChromaCon simule la productivité CaptureSMB®, l’utilisation de la résine et les économies de tampon par rapport à votre étape de capture batch
  • Les deux étapes peuvent être modélisées ensemble sous forme de lots de travaux distincts ; aucun matériel Contichrom® requis
  • Délai typique : 3–5 semaines à compter de la réception des données

→ Services de modélisation de procédé

Étude de faisabilité expérimentale — votre protéine, votre résine

Votre molécule est testée sur la plateforme Contichrom® de YMC ChromaCon dans notre site de Zurich. Nous reproduisons votre méthode batch comme référence et réalisons ≥ 3 expériences de chromatographie continue — MCSGP, CaptureSMB® ou les deux.

  • Expédiez la matière de départ à Zurich — généralement ≥ 20× un essai batch préparatif unique, à l’échelle de colonnes de 1 cm de diamètre interne
  • Nous reproduisons votre méthode analytique et établissons la référence batch en utilisant votre résine et votre système tampon
  • Livrable : rapport comparatif batch vs continu, côte à côte, avec des données réelles sur votre protéine et votre résine, plus des fractions purifiées pour votre vérification indépendante
  • MCSGP et CaptureSMB® peuvent être définis comme des lots de travaux distincts ; délai typique : 4–6 semaines après réception du matériel

→ Études de faisabilité YMC ChromaCon

Développer à l’échelle laboratoire — louer ou acheter un CUBE

Le développement de méthode, pour le polissage MCSGP comme pour la capture CaptureSMB®, est réalisé sur le Contichrom CUBE en utilisant votre résine et vos tampons existants.

  • Assistant ChromIQ® MCSGP (polissage) : établit le point de fonctionnement initial MCSGP à partir de vos conditions de gradient batch — généralement 1–2 semaines de travail expérimental
  • Assistant ChromIQ® CaptureSMB (capture) : convertit vos données de courbe de percée en un point de fonctionnement initial CaptureSMB — première exécution continue généralement réalisable en une journée
  • AutoPeak® (polissage) ou AutomAb® (capture) : contrôle de procédé configuré pendant le développement sur CUBE pour un fonctionnement robuste et sans surveillance
  • Les deux méthodes peuvent être développées successivement sur un seul CUBE

→ Programme de location Contichrom CUBE

→ Acheter un Contichrom CUBE

Passer à la production GMP — Contichrom TWIN LPLC

Les méthodes développées sur le CUBE se transfèrent directement au TWIN LPLC pour une production à l’échelle industrielle. ChromaCon fournit un accompagnement à la mise à l’échelle et un support de documentation GMP pour les deux étapes.

  • Polissage TWIN LPLC pour MCSGP — polissage continu avec la même chimie de colonne et les mêmes conditions de gradient conservées à l’échelle
  • Capture TWIN LPLC pour CaptureSMB — capture d’affinité continue en mode bind-elute à l’échelle pilote et de production
  • Les paramètres se mettent à l’échelle de manière prévisible — hauteur de lit et vitesse linéaire maintenues d’une échelle à l’autre
  • Support de documentation GMP (IQ/OQ/PQ) et accompagnement à la mise à l’échelle disponibles pour les deux étapes

→ Conseil en mise à l’échelle et formation

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